İnönü Üniversitesi, 28 Ocak 1975 tarihinde Türkiye Büyük Millet Meclisinde, 25 Mart 1975 tarihinde ise Cumhuriyet Senatosunda kabul edilen ve 3 Nisan 1975 tarihli Resmi Gazetede yayımlanarak yürürlüğe giren 1872 sayılı ‘İnönü Üniversitesi Kanunu’ ile kurulmuş olup, 1976-1977 eğitim-öğretim yılından itibaren eğitim hizmeti vermeye başlamıştır. 1984 yılına kadar şimdiki Sadreddin Konevî Anadolu İmam Hatip Lisesi binasında faaliyetlerini sürdüren Üniversitemiz, 1984-1985 Akademik Yılında mevcut yerleşkesine geçmiş ve hızla gelişmeye başlamıştır. İnönü Üniversitesi bugün 50’nci yılını kutluyor.
Malatya İnönü Üniversitesi 3 Nisan 1975’te ilk olarak Temel Bilimler Fakültesi ve Eğitim Fakültesi olarak kuruldu. 28 Şubat 1977 tarihinde Temel Bilimler Fakültesi'nin Fizik, Kimya ve Matematik bölümlerine öğrenci alınmasıyla fiilen eğitim ve öğretime başlandı.
İnönü Üniversitesi, 14 fakültesi, 1'i Devlet Konservatuvarı olmak üzere 2 yüksekokulu, 4 meslek yüksekokulu, 6 enstitüsü, 1 Teknokenti, Turgut Özal Tıp Merkezinin de aralarında bulunduğu 27 Araştırma ve Uygulama Merkeziyle yaklaşık 40 binin üzerinden öğrenciye eğitim ve öğretim hizmeti veriyor.
İktisadi ve İdari Bölümler Fakültesi,1977 yılında Çukurova Üniversitesi'ne bağlı Adana İktisadi ve Ticari İlimler Akademisi Malatya İktisadi ve Ticari İlimler Yüksekokulu adı altında kurulmuştur. 1977-1980 yılları arasında Adana İktisadi ve Ticari İlimler Akademisi'ne bağlı olarak Malatya İktisadi ve Ticari İlimler Yüksekokulu olarak öğrenime devam eden yüksekokulun adı yine Çukurova Üniversitesine bağlı olarak, önce Malatya İktisadi ve Ticari İlimler Akademisi, 2547 sayılı Yükseköğretim Kanunu ile birlikte Malatya İktisadi ve Ticari İlimler Fakültesi olarak değiştirilmiştir. 22.06.1982 tarih ve 41 sayılı Yükseköğretim Kurumları Teşkilâtı Hakkında Kanun Hükmünde Kararname ile İnönü Üniversitesi’nin yeniden yapılandırılmasından sonra, 28.03.1983 tarih ve 2809 sayılı kanunla adı İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi olarak değiştirilmiş ve İnönü Üniversitesine bağlandı.
İkinci Cumhurbaşkanı İsmet İnönü’nün 25 Aralık 1973’te vefatı üzerine Malatya’ya açılması düşünülen üniversitenin İnönü Üniversitesi adıyla kurulması için milletvekili ve senatörlerin hazırladıkları kanun, Meclis’te görüşülerek kabul edilmiş ve üniversitenin kuruluş kanununa göre Türkiye’deki üniversiteler arasında 14. sırada Temel Bilimler ve Eğitim olmak üzere iki fakülte ile kuruldu.
İnönü Üniversitesi’nde bugüne kadar görev yapan rektörler şunlar:
Prof. Dr. Süreyya Aybar Kurucu Rektör (1975-1980)
Prof. Dr. Ali Fuat Cesur (1981-1982) Rektör vekili
Prof. Dr. Nihat Nirun (1982-1983)
Prof. Dr. Cemal Aydın (1984-1984) Rektör vekili
Prof. Dr. Safa Erkün (1984-1985)
Prof. Dr. Yüksel İşyar (1985-1986)
Prof. Dr. Engin Mevlüt Gözükara (1986-1991)
Prof. Dr. M. Ali Oto (1991-1992) Rektör vekili
Prof. Dr. Behsan Önol (17 Şubat 1992-18 Ağustos 1992)
Prof. Dr. Mehmet Yücesoy (1992-1996)
Prof. Dr. Emekli Tümgeneral Ömer Şarlak (1996-2000)
Prof. Dr. Fatih Hilmioğlu (2000-2008)
Prof. Dr. Cemil Çelik (2008-2016)
Prof. Dr. Ahmet Kızılay (2016-2024)
Prof. Dr. Nusret Akpolat (2024-devam ediyor)